Wydział Ekonomii i Zarządzania funkcjonuje od 2000 r. (we wrześniu 2006r. została zmieniona nazwa z Wydziału Zarządzania i Marketingu). Od października 2008r. wydziałem kieruje dziekan doc. dr Alicja Dziuba Burczyk. Wydział Ekonomii i Zarządzania Krakowskiej Akademii im. Andrzeja Frycza Modrzewskiego oferuje kształcenie na kierunkach: ekonomia, gospodarka przestrzenna, informatyka i ekonometria, ochrona środowiska oraz zarządzanie.
W ramach każdego kierunku oferowane są specjalności dostosowane do oczekiwań rynku pracy. Znajdujące się w ofercie wydziału studia pierwszego i drugiego stopnia prowadzone są w formie stacjonarnej i niestacjonarnej. Oprócz dydaktyki pracownicy wydziału publikują artykuły, książki biorą udział w konferencjach naukowych krajowych i zagranicznych, organizują konferencje w ramach Krakowskiej Akademii im. Andrzeja Frycza Modrzewskiego, wspierają działalność kół naukowych. Wydział współpracuje z innymi ośrodkami naukowymi zarówno krajowymi jak i zagranicznymi oraz przedsiębiorstwami, jednostkami samorządowymi, Policją, Strażą Pożarną.