Głównym założeniem powstającego organu jest kreowanie w Krakowie miejsca, gdzie będzie się rozwijać innowacyjna gospodarka. Miasto nie będzie już organem, gdzie stosuje się nowoczesne technologie. Dzięki powołanej spółce będzie miało możliwość tworzenia nowych technologii i rozwiązań. Działalność Laboratorium jest także ściśle związana z pewnym projektem. Zakłada on przywrócenie do działalności prawie trzystu hektarów obszarów poprzemysłowych w Nowej Hucie. Powstaną nowe miejsca pracy nie tylko dla lokalnej społeczności, ale również dla absolwentów krakowskich uczelni wyższych.